Quando a Sun Microsystems comprou a empresa do banco de dados MySQL, uma das primeiras providências foi desenvolver uma ferramenta para modelagem de dados. Popularmente denominada de sucessora do DBDesigner 4 (gratuita), estou falando da MySQL Workbench. Excelente ferramenta. Vale a pena experimentá-la. Estão disponíveis para download, uma versão gratuita e outra paga (hoje, custando US$ 99,00).
Geração de scripts: O DBDesginer tinha um plugin que gera script para vários bancos de dados, de acordo com a escolha do usuário. Ainda não encontrei um plugin para
o MySQL Workbench que suporte geração de scripts para outras bases.